根據消毒劑的化學特性，化學消毒劑可分為七大類，它們的殺菌機理和特點如下
第一類：氧化類消毒劑：殺菌機理是釋放出新生態原子氧、氧化菌體中的活性基團。殺菌特點是作用快而強，能殺死所有微生物,包括細菌芽孢、病毒。以表面消毒為主,如二氧化氯、雙氧水、臭氧等,該類消毒劑為滅菌劑。
第二類：醛類消毒劑：殺菌機理是使蛋白變性或烷基化；殺菌特點是對細菌、芽孢、真菌、病毒均有效。但溫度影響較大。如甲醛、戊二醛等。該類消毒劑可做滅菌劑使用。
第三類：酚類消毒劑：殺菌機理是使蛋白變性、沉淀或使酶系統失活；殺菌特點是對真菌和部分病毒有效。
第四類：醇類消毒劑：殺菌機理是使蛋白變性,干擾代謝；殺菌特點是對細菌有效,對芽孢、真菌、病毒無效,如乙醇、乙丙醇等。該類消毒劑為中效消毒劑，只能用于一般性消毒。
第五類：堿、鹽類消毒劑：殺菌機理是使蛋白變性、沉淀或溶解；殺菌特點是能殺死細菌繁殖體,但不能殺死細菌芽孢、病毒和一些難殺死的微生物。殺菌作用弱,有強腐蝕性,如硝酸、火堿、食鹽等。只能作為一般性預防消毒劑。
第六類：鹵素類消毒劑：殺菌機理是氧化菌體中的活性基因,與氨基結合使蛋白變性。特點是能殺死大部分微生物，以表面消毒為主,性質不穩定，殺菌效果受環境條件影響大,如次氯酸鈉、“84”消毒液、優氯凈等。該類消毒劑為中效消毒劑，可以作為一般消毒劑使用。
第七類：表面活性劑類消毒劑：殺菌機理是改變細胞膜透性,使細胞質外漏，防礙呼吸或使蛋白酶變性。殺菌特點是能殺死細菌繁殖體,但對芽孢、真菌、病毒、結核病菌作用差。堿性、中性條件下效果好,如新潔爾滅、百毒殺等。該類消毒劑為中低效消毒劑，可以作為一般消毒劑使用。